肛瘘的发生，绝大多数来源于肛门周围脓肿，而肛周脓肿的来源则有多方面的原因。治疗肛瘘有点难度，大多数的肛瘘患者都有这样的经验，不重视肛瘘的治疗，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。所以做好预防肛瘘的措施很重要。
因此，根据临床中的情况，我们认为预防肛瘘应注意以下几个方面：
1、要保持肛门清洁：养成便后洗净局部或每日早晚清洗肛门的习惯，保持肛门清洁。
2、饮食要洁净：不洁饮食，可导致腹泻，极易造成肛门腺感染，引起肛瘘。
3、定时排便：要养成定时排便的好习惯，防止大便干结，损伤肛管皮肤，造成感染。
4、极早治疗全身疾病：如糖尿病等患者，应尽早治疗全身疾病，才能控制由此而带来或加重的肛门感染。
5、检查轻柔：在肛门常规检查时，要轻柔，切忌暴力，以免损伤肛门。同时，大便干结需作灌肠时，也应注意，不要造成肛门损伤。